Esta Agrupación fue creada en el mes de Septiembre de 1986 como Banda de Cornetas y Tambores Isla de León "Junior", bajo la dirección de José Puertas Martínez y la musical de Francisco Bermejo.
Su primera salida fue con motivo de la cabalgata de reyes de la Barriada de la Bazán dónde esta ubicada su sede desde el 4 de Enero de 1987. Sus actuaciones casi siempre desinteresadas, han dado brillantez a casi todas las veladas que se han realizado en nuestra ciudad, como cabalgatas de Reyes y Carnaval asi como en Semana Santa y otros actos.
En el año 1996 y en el II Certamen de Marchas Procesionales de la Asociación Cofrade "El Aguaero" se presentó la banda de cornetas como Agrupación Musical Isla de León con 60 componentes, intrumentación nueva y uniforme de gala de S.M. el Rey. La dirección de la misma desde entonces y hasta nuestros días está a cargo de D. Jorge Vidal Moreno, el cual comienzó a dar el cambio de Banda de Cornetas y Tambores a Agrupación Musical y realizó la labor de preparar la Agrupación, de cara a la Semana Santa.
Esta Agrupación cuenta con el apadrinamiento de la Banda de Cornetas y Tambores Stmo. Cristo de la Caridad (Jerez), que se realizó en la celebración del II Certamen de Marchas Procesionales "El Aguaero" coincidiendo con su presentación como Agrupación Musical y también con el de la Agrupación Musical Nuestro Padre Jesús de la Redención de Sevilla, acto que tuvo lugar el 20 de Enero de 2002 en el Ayuntamiento de San Fernando con motivo del V Aniversario de Isla de León, donde ambas Agrupaciones ofrecieron un concierto conjunto.
En el mes de Diciembre del 2001, la Agrupación se desplaza a Sevilla para realizar el sueño de sus 5 años, la primera grabación de un CD, con marchas de conocidos autores como los sevillanos D. Emilio Muñoz Serna y D. Francisco David Álvarez Barroso. Este se graba en los estudios de Alta Frecuencia de Sevilla y es Editado por Pasarela, la cual se encarga de distribuirlo por toda la geografía española. La dirección musical está a cargo del sevillano D. Emilio Muñoz Serna, director musical de la Agrupación Musical Jesús de la Redención de Sevilla. El título de este es "Al Señor de la Humildad" y contiene las marchas "Al Señor de la Humildad" de Emilio Muñoz Serna, " Mi Cristo Redentor" "En tus Lágrimas de Angustias" entre otras. Este fue presentado en el mes de Febrero del 2002 en el salón de actos del colegio de las Carmelitas.
Se van rompiedo fronteras y la Agrupación ofrece un concierto en la sevillana Plaza del Duque, junto a la Campana, con motivo de promocionar su disco "Al Señor de la Humildad".
En la cuaresma del 2003 la agrupación se hermana con la Cofradía de Humildad y Paciencia de San Fernando, perteneciendo desde este momento a dicha Hermandad y pasando de llamarse A.M. Isla de León a Agrupación Musical Santísimo Cristo de Humildad y Paciencia.
En diciembre del 2003 la agrupación se desplaza a Sevilla para la grabación de su segundo trabajo discográfico que al igual que el primero es grabado en los estudios Alta Frecuencia y editado por Pasarela. La dirección de la agrupación esta a cargo de D. Jorge Vidal Moreno y la musical de D. Emilio Muñoz Serna.
En la cuaresma del 2004 se presenta el segundo trabajo discográfico. El título de este es "Bulerías de Pasión" y contiene marchas de compositores sevillanos como Jorge Valera y Emilio Muñoz. Junto a la presentación de este también se hizo la presentación de lo que sería durante las próximas actuaciones el uniforme oficial de la banda.
Durante el mes de Mayo la agrupación acompaña durante todos los fines de semana a las numerosas cruces de mayo que realizan su procesión en la provincia y fuera de ella, concretamente en Sevilla, a la procesión de San José de la Montaña y la Virgen de la Estrellita de Triana.
En la tarde del Lunes Santo de 2005 durante la estación de penitencia de la cofradia de Jesús Cautivo (Medinaceli) técnicos de la editora sevillana Pasarela se desplazaron a San Fernando para grabar por segundo año consecutivo a la agrupación en directo.
Durante los meses de Mayo, como novedad en contratos, a parte de las Cruces de Mayo, la procesión de la Virgen de la Mercéd de Sevilla contaba con el acompañamiento de la Agrupación.
En plena cuaresma de 2006, tras varios certamenes y conciertos, llegó un dia señalado para la Agrupación. Presentación de "Medinaceli", cuarto trabajo discográfico de la Agrupación. El trabajo recoje sonidos en directo del Lunes Santo de 2005 tanto por parte de la Agrupación como por los sones de la Banda Municipal de San Fernando, además de marchas propias interpretadas a piano por el sevillano Enrique Garfia. Todo tuvo lugar el 10 de Marzo en el salón de Actos del Colegio Compañia de Maria.
Tras todo un mes de Mayo Mariano acompañando a Hermandades de Gloria y Cruces de Mayo por toda Andalucía el 15 de Agosto tuvimos la oportunidad una vez más de acompañar a la Divina Pastora de las Almas Coronada en su procesión de Gloria y Alabanza por las calles de La Isla.
El 22 de Septiembre con motivo del XXV Aniversario de la fundación de la Hermandad del Gran Poder de San Fernando tuvo lugar un concierto a cargo de la Banda de Música de la Cruz Roja y la Agrupación. Este acto sirvió para la presentación de PODER Y AMOR, Miércoles Santo 2006, DVD realizado durante la estación de Penitencia de la Cofradía del Gran Poder. Un DVD que recoje las mejores imágenes del largo recorrido en formato multicamara y producido conjuntamente con la Banda de la Cruz Roja de San Fernando.
El 24 de Septiembre y coincidiendo con las fiestas que se celebran en nuestra ciudad con motivo de las Cortes de 1810, acompañamos a Jesús del Gran Poder en su camino de vuelta desde la Iglesia Mayor a la Parroquia de la Sagrada Familia en el barrio de la Bazán con motivo de la salida extraordinaria del XXV Aniversario Fundacional.
El acto sirvió para la presentación de la primera fase del nuevo banderín de la Agrupación.
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En Septiembre del mismo año la agrupación va adquiriendo contratos fuera de la provincia y se trasladan a la capital hispalense para acompañar musicalmente en Triana (Sevilla) al paso de la Virgen de la Estrellita. 
Durante la estación de penitencia de la Cofradía de Humildad y Paciencia del 2004 los técnicos de la editora Pasarela se desplazan hasta San Fernando para la grabación en directo del tercer trabajo discográfico. Acompañando al CD de Audio se añadia un DVD con las imágenes recogidas por tres cámaras durante el recorrido por las calles de la Isla. Además de la grabación de este disco la agrupación estrenó el uniforme de gala de uso exclusivo en los acompañamientos del Domingo de Ramos. 
Mencionar, que el Domingo de Resurrección 2005, para San Fernando, fué histórico, ya que la Hermandad de Jesús Resucitado puso su Cruz de Guía por primera vez en la calle y el acompañamiento musical estuvo a cargo de la Agrupación.
El 2007 no podría tener mejor comienzo, la Agrupación se desplazó el sábado 3 de febrero hasta la capital española para actuar en un concierto de marchas en la Feria Internacional del Turismo, FITUR 2007, en la feria de Madrid, IFEMA.